Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD40LGP29965 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD40LGP29965 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms