Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD1P29536 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMOD1P29536 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms