Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMLP26374 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMLP26374 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMLP26374 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMLP26374 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMLP26374 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMLP26374 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMLP26374 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMLP26374 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMLP26374 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMLP26374 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMLP26374 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMLP26374 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMLP26374 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMLP26374 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMLP26374 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMLP26374 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMLP26374 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMLP26374 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMLP26374 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMLP26374 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMLP26374 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMLP26374 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMLP26374 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMLP26374 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMLP26374 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMLP26374 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMLP26374 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMLP26374 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMLP26374 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMLP26374 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMLP26374 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMLP26374 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMLP26374 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMLP26374 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMLP26374 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMLP26374 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMLP26374 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMLP26374 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMLP26374 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMLP26374 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMLP26374 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMLP26374 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMLP26374 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMLP26374 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMLP26374 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMLP26374 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMLP26374 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMLP26374 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMLP26374 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMLP26374 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMLP26374 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMLP26374 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMLP26374 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMLP26374 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMLP26374 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMLP26374 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMLP26374 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMLP26374 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMLP26374 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMLP26374 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMLP26374 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMLP26374 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMLP26374 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMLP26374 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMLP26374 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMLP26374 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMLP26374 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMLP26374 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMLP26374 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMLP26374 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMLP26374 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMLP26374 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMLP26374 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMLP26374 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMLP26374 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMLP26374 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMLP26374 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMLP26374 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMLP26374 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMLP26374 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMLP26374 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMLP26374 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMLP26374 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMLP26374 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMLP26374 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMLP26374 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMLP26374 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMLP26374 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMLP26374 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMLP26374 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMLP26374 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMLP26374 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMLP26374 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMLP26374 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMLP26374 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMLP26374 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMLP26374 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMLP26374 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMLP26374 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms