Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LAMA1P25391 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms