Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFSF4P23510 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF4P23510 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms