Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRDP23468 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
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