Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGA6P23229 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms