Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT15P19012 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT15P19012 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT15P19012 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT15P19012 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT15P19012 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT15P19012 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT15P19012 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT15P19012 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT15P19012 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT15P19012 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT15P19012 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT15P19012 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT15P19012 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT15P19012 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT15P19012 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT15P19012 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT15P19012 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT15P19012 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT15P19012 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT15P19012 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT15P19012 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT15P19012 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT15P19012 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT15P19012 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT15P19012 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT15P19012 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT15P19012 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT15P19012 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT15P19012 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT15P19012 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT15P19012 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT15P19012 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT15P19012 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT15P19012 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT15P19012 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT15P19012 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT15P19012 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT15P19012 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT15P19012 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT15P19012 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT15P19012 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT15P19012 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT15P19012 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT15P19012 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT15P19012 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT15P19012 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT15P19012 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT15P19012 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT15P19012 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT15P19012 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT15P19012 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT15P19012 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT15P19012 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT15P19012 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT15P19012 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT15P19012 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT15P19012 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT15P19012 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT15P19012 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT15P19012 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT15P19012 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT15P19012 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT15P19012 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT15P19012 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT15P19012 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT15P19012 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT15P19012 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT15P19012 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT15P19012 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT15P19012 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT15P19012 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT15P19012 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT15P19012 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT15P19012 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT15P19012 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT15P19012 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT15P19012 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT15P19012 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT15P19012 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT15P19012 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT15P19012 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT15P19012 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT15P19012 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT15P19012 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT15P19012 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT15P19012 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT15P19012 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT15P19012 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT15P19012 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT15P19012 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT15P19012 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT15P19012 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT15P19012 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT15P19012 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT15P19012 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT15P19012 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT15P19012 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT15P19012 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT15P19012 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms