Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGAM1P18669 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms