Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms