Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPGDP15428 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPGDP15428 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPGDP15428 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPGDP15428 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPGDP15428 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPGDP15428 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPGDP15428 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPGDP15428 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPGDP15428 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPGDP15428 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPGDP15428 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPGDP15428 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPGDP15428 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPGDP15428 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPGDP15428 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPGDP15428 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPGDP15428 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPGDP15428 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPGDP15428 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPGDP15428 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPGDP15428 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPGDP15428 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPGDP15428 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HPGDP15428 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPGDP15428 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPGDP15428 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPGDP15428 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPGDP15428 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPGDP15428 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPGDP15428 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPGDP15428 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPGDP15428 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPGDP15428 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPGDP15428 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPGDP15428 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPGDP15428 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPGDP15428 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPGDP15428 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPGDP15428 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HPGDP15428 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPGDP15428 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPGDP15428 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPGDP15428 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPGDP15428 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPGDP15428 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPGDP15428 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPGDP15428 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPGDP15428 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPGDP15428 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPGDP15428 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPGDP15428 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HPGDP15428 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HPGDP15428 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPGDP15428 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPGDP15428 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPGDP15428 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPGDP15428 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPGDP15428 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPGDP15428 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPGDP15428 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPGDP15428 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPGDP15428 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPGDP15428 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPGDP15428 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPGDP15428 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPGDP15428 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPGDP15428 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPGDP15428 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPGDP15428 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPGDP15428 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPGDP15428 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPGDP15428 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HPGDP15428 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HPGDP15428 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HPGDP15428 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HPGDP15428 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HPGDP15428 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HPGDP15428 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HPGDP15428 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HPGDP15428 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HPGDP15428 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HPGDP15428 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HPGDP15428 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HPGDP15428 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HPGDP15428 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HPGDP15428 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HPGDP15428 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HPGDP15428 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HPGDP15428 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HPGDP15428 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPGDP15428 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPGDP15428 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HPGDP15428 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPGDP15428 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPGDP15428 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPGDP15428 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPGDP15428 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPGDP15428 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPGDP15428 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms