Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GFAPP14136 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFAPP14136 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFAPP14136 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFAPP14136 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFAPP14136 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFAPP14136 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFAPP14136 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GFAPP14136 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GFAPP14136 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFAPP14136 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFAPP14136 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFAPP14136 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFAPP14136 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFAPP14136 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFAPP14136 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFAPP14136 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFAPP14136 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFAPP14136 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFAPP14136 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFAPP14136 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFAPP14136 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFAPP14136 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFAPP14136 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFAPP14136 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFAPP14136 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GFAPP14136 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFAPP14136 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFAPP14136 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFAPP14136 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFAPP14136 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFAPP14136 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFAPP14136 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFAPP14136 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFAPP14136 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFAPP14136 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFAPP14136 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFAPP14136 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFAPP14136 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFAPP14136 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFAPP14136 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFAPP14136 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFAPP14136 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFAPP14136 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFAPP14136 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFAPP14136 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFAPP14136 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFAPP14136 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFAPP14136 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFAPP14136 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFAPP14136 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFAPP14136 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFAPP14136 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFAPP14136 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFAPP14136 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFAPP14136 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFAPP14136 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GFAPP14136 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFAPP14136 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFAPP14136 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFAPP14136 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFAPP14136 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GFAPP14136 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFAPP14136 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFAPP14136 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFAPP14136 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFAPP14136 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFAPP14136 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GFAPP14136 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFAPP14136 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFAPP14136 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFAPP14136 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFAPP14136 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFAPP14136 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFAPP14136 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFAPP14136 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFAPP14136 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFAPP14136 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFAPP14136 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFAPP14136 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFAPP14136 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFAPP14136 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFAPP14136 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GFAPP14136 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms