Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCL5P13501 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCL5P13501 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCL5P13501 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCL5P13501 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCL5P13501 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCL5P13501 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCL5P13501 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCL5P13501 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCL5P13501 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCL5P13501 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCL5P13501 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCL5P13501 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCL5P13501 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCL5P13501 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCL5P13501 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCL5P13501 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCL5P13501 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCL5P13501 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCL5P13501 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCL5P13501 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCL5P13501 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCL5P13501 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCL5P13501 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCL5P13501 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL5P13501 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL5P13501 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL5P13501 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL5P13501 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL5P13501 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL5P13501 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL5P13501 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL5P13501 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL5P13501 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCL5P13501 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCL5P13501 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCL5P13501 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCL5P13501 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL5P13501 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL5P13501 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL5P13501 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL5P13501 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL5P13501 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL5P13501 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL5P13501 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL5P13501 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL5P13501 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL5P13501 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL5P13501 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL5P13501 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL5P13501 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL5P13501 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL5P13501 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL5P13501 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL5P13501 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL5P13501 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL5P13501 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL5P13501 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL5P13501 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL5P13501 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL5P13501 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL5P13501 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCL5P13501 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCL5P13501 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCL5P13501 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCL5P13501 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCL5P13501 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL5P13501 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL5P13501 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL5P13501 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL5P13501 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL5P13501 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL5P13501 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL5P13501 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCL5P13501 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCL5P13501 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCL5P13501 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCL5P13501 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCL5P13501 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCL5P13501 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCL5P13501 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL5P13501 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL5P13501 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL5P13501 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL5P13501 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL5P13501 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL5P13501 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL5P13501 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL5P13501 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL5P13501 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL5P13501 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL5P13501 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL5P13501 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL5P13501 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL5P13501 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL5P13501 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL5P13501 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL5P13501 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL5P13501 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCL5P13501 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms