Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD8P13378 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms