Protein–RNA interactions for Protein: P12931

SRC, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCP12931 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRCP12931 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRCP12931 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRCP12931 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRCP12931 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRCP12931 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRCP12931 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRCP12931 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRCP12931 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRCP12931 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRCP12931 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRCP12931 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRCP12931 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRCP12931 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRCP12931 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRCP12931 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRCP12931 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRCP12931 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRCP12931 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRCP12931 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRCP12931 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRCP12931 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRCP12931 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRCP12931 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRCP12931 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRCP12931 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRCP12931 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRCP12931 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRCP12931 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRCP12931 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRCP12931 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRCP12931 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRCP12931 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SRCP12931 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRCP12931 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRCP12931 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRCP12931 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRCP12931 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRCP12931 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRCP12931 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRCP12931 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SRCP12931 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRCP12931 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRCP12931 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRCP12931 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRCP12931 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRCP12931 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRCP12931 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRCP12931 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRCP12931 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRCP12931 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRCP12931 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRCP12931 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRCP12931 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRCP12931 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRCP12931 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRCP12931 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRCP12931 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRCP12931 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRCP12931 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRCP12931 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRCP12931 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRCP12931 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRCP12931 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRCP12931 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRCP12931 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRCP12931 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRCP12931 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRCP12931 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRCP12931 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRCP12931 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRCP12931 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRCP12931 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRCP12931 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRCP12931 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRCP12931 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRCP12931 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRCP12931 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRCP12931 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRCP12931 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRCP12931 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRCP12931 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRCP12931 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRCP12931 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRCP12931 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms