Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRP12270 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRP12270 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRP12270 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRP12270 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRP12270 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRP12270 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRP12270 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRP12270 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRP12270 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRP12270 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRP12270 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRP12270 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRP12270 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRP12270 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRP12270 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRP12270 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRP12270 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRP12270 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRP12270 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRP12270 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRP12270 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRP12270 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRP12270 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRP12270 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRP12270 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRP12270 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRP12270 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRP12270 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRP12270 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRP12270 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRP12270 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRP12270 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRP12270 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRP12270 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRP12270 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRP12270 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRP12270 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRP12270 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRP12270 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRP12270 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRP12270 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRP12270 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRP12270 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRP12270 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRP12270 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRP12270 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRP12270 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRP12270 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRP12270 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRP12270 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRP12270 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRP12270 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRP12270 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRP12270 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRP12270 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRP12270 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRP12270 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRP12270 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRP12270 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRP12270 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRP12270 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRP12270 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRP12270 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRP12270 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRP12270 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRP12270 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRP12270 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRP12270 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRP12270 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRP12270 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRP12270 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRP12270 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRP12270 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRP12270 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRP12270 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRP12270 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPRP12270 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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