Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VDRP11473 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VDRP11473 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VDRP11473 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VDRP11473 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VDRP11473 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VDRP11473 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VDRP11473 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VDRP11473 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VDRP11473 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VDRP11473 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VDRP11473 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VDRP11473 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VDRP11473 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VDRP11473 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VDRP11473 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VDRP11473 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VDRP11473 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VDRP11473 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VDRP11473 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VDRP11473 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VDRP11473 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VDRP11473 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
VDRP11473 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VDRP11473 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VDRP11473 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VDRP11473 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VDRP11473 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VDRP11473 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VDRP11473 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VDRP11473 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VDRP11473 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VDRP11473 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VDRP11473 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VDRP11473 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VDRP11473 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VDRP11473 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VDRP11473 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VDRP11473 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VDRP11473 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VDRP11473 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VDRP11473 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VDRP11473 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VDRP11473 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VDRP11473 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VDRP11473 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VDRP11473 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VDRP11473 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VDRP11473 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VDRP11473 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VDRP11473 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VDRP11473 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VDRP11473 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VDRP11473 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VDRP11473 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VDRP11473 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VDRP11473 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VDRP11473 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VDRP11473 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VDRP11473 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VDRP11473 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VDRP11473 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VDRP11473 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VDRP11473 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VDRP11473 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VDRP11473 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VDRP11473 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VDRP11473 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VDRP11473 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VDRP11473 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VDRP11473 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VDRP11473 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VDRP11473 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VDRP11473 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VDRP11473 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VDRP11473 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VDRP11473 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VDRP11473 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VDRP11473 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VDRP11473 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VDRP11473 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VDRP11473 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VDRP11473 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VDRP11473 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VDRP11473 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VDRP11473 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VDRP11473 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VDRP11473 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VDRP11473 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VDRP11473 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VDRP11473 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VDRP11473 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
VDRP11473 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VDRP11473 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VDRP11473 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VDRP11473 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VDRP11473 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VDRP11473 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VDRP11473 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VDRP11473 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms