Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP1P11387 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP1P11387 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP1P11387 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP1P11387 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP1P11387 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP1P11387 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP1P11387 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP1P11387 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP1P11387 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP1P11387 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP1P11387 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP1P11387 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP1P11387 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP1P11387 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TOP1P11387 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TOP1P11387 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TOP1P11387 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP1P11387 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP1P11387 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP1P11387 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP1P11387 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP1P11387 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP1P11387 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP1P11387 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP1P11387 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP1P11387 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP1P11387 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP1P11387 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP1P11387 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1P11387 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1P11387 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1P11387 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1P11387 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1P11387 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1P11387 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1P11387 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1P11387 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1P11387 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1P11387 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1P11387 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1P11387 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1P11387 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1P11387 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1P11387 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP1P11387 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP1P11387 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP1P11387 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP1P11387 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP1P11387 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP1P11387 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP1P11387 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP1P11387 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP1P11387 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP1P11387 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP1P11387 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP1P11387 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP1P11387 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOP1P11387 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOP1P11387 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOP1P11387 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOP1P11387 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOP1P11387 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP1P11387 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP1P11387 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP1P11387 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP1P11387 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP1P11387 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP1P11387 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP1P11387 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP1P11387 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP1P11387 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP1P11387 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP1P11387 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOP1P11387 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOP1P11387 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOP1P11387 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOP1P11387 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOP1P11387 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOP1P11387 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOP1P11387 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOP1P11387 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOP1P11387 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOP1P11387 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOP1P11387 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOP1P11387 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOP1P11387 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOP1P11387 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOP1P11387 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1P11387 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1P11387 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1P11387 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1P11387 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1P11387 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1P11387 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1P11387 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1P11387 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1P11387 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1P11387 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1P11387 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms