Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRFP10586 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms