Protein–RNA interactions for Protein: P10092

CALCB, Calcitonin gene-related peptide 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCBP10092 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCBP10092 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCBP10092 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCBP10092 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCBP10092 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCBP10092 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCBP10092 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCBP10092 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCBP10092 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCBP10092 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCBP10092 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCBP10092 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCBP10092 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCBP10092 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCBP10092 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCBP10092 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCBP10092 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCBP10092 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCBP10092 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCBP10092 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCBP10092 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCBP10092 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCBP10092 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCBP10092 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCBP10092 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCBP10092 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCBP10092 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCBP10092 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCBP10092 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCBP10092 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCBP10092 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCBP10092 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCBP10092 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCBP10092 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCBP10092 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCBP10092 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCBP10092 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCBP10092 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCBP10092 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCBP10092 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCBP10092 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCBP10092 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCBP10092 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCBP10092 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCBP10092 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCBP10092 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCBP10092 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCBP10092 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCBP10092 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCBP10092 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCBP10092 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCBP10092 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCBP10092 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCBP10092 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCBP10092 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCBP10092 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCBP10092 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCBP10092 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCBP10092 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCBP10092 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCBP10092 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCBP10092 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCBP10092 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCBP10092 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCBP10092 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCBP10092 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCBP10092 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCBP10092 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms