Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf88P0DMB2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 404.4 ms