Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRR35P0CG20 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms