Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDGFRBP09619 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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