Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP1P09455 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP1P09455 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP1P09455 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP1P09455 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP1P09455 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP1P09455 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP1P09455 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP1P09455 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP1P09455 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP1P09455 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP1P09455 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP1P09455 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP1P09455 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP1P09455 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP1P09455 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP1P09455 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP1P09455 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP1P09455 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP1P09455 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP1P09455 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP1P09455 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP1P09455 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP1P09455 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP1P09455 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP1P09455 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP1P09455 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP1P09455 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP1P09455 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP1P09455 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP1P09455 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP1P09455 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP1P09455 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP1P09455 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP1P09455 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP1P09455 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP1P09455 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP1P09455 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP1P09455 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP1P09455 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP1P09455 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP1P09455 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP1P09455 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBP1P09455 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP1P09455 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP1P09455 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP1P09455 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP1P09455 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP1P09455 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP1P09455 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP1P09455 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP1P09455 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP1P09455 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP1P09455 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP1P09455 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP1P09455 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP1P09455 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP1P09455 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP1P09455 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP1P09455 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP1P09455 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP1P09455 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP1P09455 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP1P09455 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP1P09455 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP1P09455 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP1P09455 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP1P09455 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP1P09455 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP1P09455 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP1P09455 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP1P09455 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP1P09455 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP1P09455 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP1P09455 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP1P09455 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP1P09455 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP1P09455 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP1P09455 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP1P09455 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP1P09455 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP1P09455 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP1P09455 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms