Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT19P08727 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT19P08727 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT19P08727 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT19P08727 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT19P08727 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT19P08727 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT19P08727 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT19P08727 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT19P08727 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT19P08727 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT19P08727 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT19P08727 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT19P08727 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT19P08727 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT19P08727 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT19P08727 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT19P08727 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT19P08727 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT19P08727 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT19P08727 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT19P08727 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT19P08727 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT19P08727 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT19P08727 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT19P08727 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT19P08727 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT19P08727 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT19P08727 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT19P08727 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT19P08727 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT19P08727 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT19P08727 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT19P08727 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT19P08727 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT19P08727 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT19P08727 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT19P08727 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT19P08727 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT19P08727 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT19P08727 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT19P08727 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT19P08727 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT19P08727 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT19P08727 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT19P08727 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT19P08727 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT19P08727 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT19P08727 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT19P08727 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT19P08727 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT19P08727 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT19P08727 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT19P08727 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT19P08727 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT19P08727 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT19P08727 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT19P08727 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT19P08727 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT19P08727 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT19P08727 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT19P08727 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT19P08727 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT19P08727 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT19P08727 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT19P08727 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT19P08727 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT19P08727 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT19P08727 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT19P08727 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT19P08727 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT19P08727 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT19P08727 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT19P08727 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT19P08727 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT19P08727 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT19P08727 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT19P08727 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT19P08727 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT19P08727 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT19P08727 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT19P08727 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT19P08727 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT19P08727 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT19P08727 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT19P08727 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT19P08727 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT19P08727 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT19P08727 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT19P08727 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT19P08727 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT19P08727 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT19P08727 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT19P08727 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT19P08727 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT19P08727 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT19P08727 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT19P08727 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT19P08727 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT19P08727 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms