Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBBP07437 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBBP07437 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBBP07437 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBBP07437 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBBP07437 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBBP07437 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBBP07437 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBBP07437 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBBP07437 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBBP07437 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBBP07437 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBBP07437 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBBP07437 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBBP07437 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBBP07437 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBBP07437 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBBP07437 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBBP07437 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBBP07437 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBBP07437 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBBP07437 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBBP07437 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBBP07437 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBBP07437 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBBP07437 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBBP07437 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBBP07437 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBBP07437 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBBP07437 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBBP07437 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBBP07437 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBBP07437 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBBP07437 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBBP07437 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBBP07437 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBBP07437 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBBP07437 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBBP07437 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBBP07437 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBBP07437 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBBP07437 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBBP07437 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBBP07437 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBBP07437 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBBP07437 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBBP07437 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBBP07437 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBBP07437 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBBP07437 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBBP07437 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBBP07437 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBBP07437 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBBP07437 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBBP07437 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBBP07437 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBBP07437 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBBP07437 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBBP07437 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBBP07437 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBBP07437 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBBP07437 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBBP07437 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBBP07437 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBBP07437 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBBP07437 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBBP07437 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBBP07437 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBBP07437 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBBP07437 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBBP07437 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBBP07437 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBBP07437 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBBP07437 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBBP07437 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBBP07437 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBBP07437 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBBP07437 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBBP07437 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBBP07437 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBBP07437 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBBP07437 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBBP07437 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBBP07437 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBBP07437 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms