Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDN1P05305 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDN1P05305 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDN1P05305 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDN1P05305 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDN1P05305 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDN1P05305 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDN1P05305 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDN1P05305 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EDN1P05305 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDN1P05305 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDN1P05305 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDN1P05305 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDN1P05305 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDN1P05305 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDN1P05305 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDN1P05305 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDN1P05305 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDN1P05305 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDN1P05305 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EDN1P05305 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EDN1P05305 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDN1P05305 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDN1P05305 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDN1P05305 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDN1P05305 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDN1P05305 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDN1P05305 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDN1P05305 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDN1P05305 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDN1P05305 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDN1P05305 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDN1P05305 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDN1P05305 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDN1P05305 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDN1P05305 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDN1P05305 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EDN1P05305 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDN1P05305 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDN1P05305 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDN1P05305 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDN1P05305 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDN1P05305 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDN1P05305 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDN1P05305 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDN1P05305 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDN1P05305 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDN1P05305 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDN1P05305 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDN1P05305 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDN1P05305 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDN1P05305 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDN1P05305 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDN1P05305 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDN1P05305 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EDN1P05305 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDN1P05305 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDN1P05305 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDN1P05305 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EDN1P05305 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDN1P05305 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDN1P05305 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDN1P05305 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDN1P05305 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDN1P05305 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EDN1P05305 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDN1P05305 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDN1P05305 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDN1P05305 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDN1P05305 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDN1P05305 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDN1P05305 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDN1P05305 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDN1P05305 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDN1P05305 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDN1P05305 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDN1P05305 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDN1P05305 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDN1P05305 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDN1P05305 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDN1P05305 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EDN1P05305 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDN1P05305 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDN1P05305 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EDN1P05305 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDN1P05305 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDN1P05305 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDN1P05305 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDN1P05305 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDN1P05305 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDN1P05305 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDN1P05305 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDN1P05305 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDN1P05305 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDN1P05305 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDN1P05305 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EDN1P05305 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDN1P05305 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDN1P05305 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDN1P05305 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms