Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTA1P02549 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms