Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASS1P00966 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ASS1P00966 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASS1P00966 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASS1P00966 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASS1P00966 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ASS1P00966 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ASS1P00966 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASS1P00966 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASS1P00966 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASS1P00966 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASS1P00966 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASS1P00966 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASS1P00966 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASS1P00966 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASS1P00966 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASS1P00966 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASS1P00966 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASS1P00966 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASS1P00966 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASS1P00966 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASS1P00966 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASS1P00966 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASS1P00966 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASS1P00966 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASS1P00966 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASS1P00966 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASS1P00966 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASS1P00966 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASS1P00966 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASS1P00966 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASS1P00966 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASS1P00966 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASS1P00966 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASS1P00966 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASS1P00966 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASS1P00966 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASS1P00966 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASS1P00966 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASS1P00966 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASS1P00966 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASS1P00966 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASS1P00966 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASS1P00966 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASS1P00966 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASS1P00966 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASS1P00966 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASS1P00966 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASS1P00966 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASS1P00966 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASS1P00966 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASS1P00966 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASS1P00966 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASS1P00966 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASS1P00966 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASS1P00966 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASS1P00966 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASS1P00966 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASS1P00966 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASS1P00966 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASS1P00966 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASS1P00966 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASS1P00966 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASS1P00966 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ASS1P00966 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASS1P00966 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASS1P00966 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASS1P00966 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASS1P00966 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASS1P00966 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ASS1P00966 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASS1P00966 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASS1P00966 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASS1P00966 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASS1P00966 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASS1P00966 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASS1P00966 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASS1P00966 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASS1P00966 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASS1P00966 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASS1P00966 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASS1P00966 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASS1P00966 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASS1P00966 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASS1P00966 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASS1P00966 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASS1P00966 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASS1P00966 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASS1P00966 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASS1P00966 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASS1P00966 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASS1P00966 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ASS1P00966 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASS1P00966 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASS1P00966 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASS1P00966 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASS1P00966 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASS1P00966 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASS1P00966 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASS1P00966 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1379.9 ms