Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F9P00740 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
F9P00740 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
F9P00740 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
F9P00740 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
F9P00740 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F9P00740 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
F9P00740 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
F9P00740 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F9P00740 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P00740 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P00740 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P00740 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P00740 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P00740 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P00740 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P00740 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P00740 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P00740 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P00740 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P00740 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P00740 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P00740 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P00740 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
F9P00740 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
F9P00740 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
F9P00740 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
F9P00740 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
F9P00740 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
F9P00740 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
F9P00740 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
F9P00740 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
F9P00740 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F9P00740 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F9P00740 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F9P00740 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
F9P00740 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F9P00740 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F9P00740 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F9P00740 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F9P00740 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
F9P00740 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F9P00740 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
F9P00740 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F9P00740 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
F9P00740 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
F9P00740 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
F9P00740 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
F9P00740 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P00740 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P00740 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P00740 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P00740 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P00740 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P00740 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P00740 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P00740 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P00740 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P00740 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P00740 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P00740 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P00740 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P00740 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P00740 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P00740 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P00740 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P00740 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P00740 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P00740 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P00740 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F9P00740 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F9P00740 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F9P00740 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
F9P00740 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
F9P00740 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
F9P00740 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
F9P00740 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F9P00740 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
F9P00740 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
F9P00740 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
F9P00740 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
F9P00740 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
F9P00740 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
F9P00740 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
F9P00740 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
F9P00740 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
F9P00740 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
F9P00740 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
F9P00740 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
F9P00740 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
F9P00740 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
F9P00740 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
F9P00740 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F9P00740 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F9P00740 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F9P00740 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F9P00740 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
F9P00740 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
F9P00740 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F9P00740 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms