Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CPNE6O95741 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms