Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP29O95721 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP29O95721 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP29O95721 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP29O95721 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP29O95721 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP29O95721 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP29O95721 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP29O95721 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP29O95721 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP29O95721 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNAP29O95721 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP29O95721 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms