Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTDNEP1O95476 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTDNEP1O95476 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1O95476 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1O95476 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1O95476 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1O95476 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1O95476 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms