Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB11O95342 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB11O95342 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms