Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRATO95237 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRATO95237 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRATO95237 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRATO95237 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRATO95237 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRATO95237 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRATO95237 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRATO95237 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRATO95237 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRATO95237 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRATO95237 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRATO95237 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRATO95237 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRATO95237 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRATO95237 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRATO95237 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRATO95237 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRATO95237 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRATO95237 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRATO95237 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRATO95237 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRATO95237 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRATO95237 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRATO95237 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRATO95237 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRATO95237 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRATO95237 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRATO95237 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRATO95237 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRATO95237 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRATO95237 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRATO95237 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRATO95237 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRATO95237 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRATO95237 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRATO95237 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRATO95237 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRATO95237 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRATO95237 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRATO95237 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRATO95237 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRATO95237 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRATO95237 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRATO95237 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRATO95237 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRATO95237 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRATO95237 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRATO95237 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRATO95237 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRATO95237 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRATO95237 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRATO95237 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRATO95237 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRATO95237 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRATO95237 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRATO95237 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRATO95237 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRATO95237 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRATO95237 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRATO95237 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRATO95237 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRATO95237 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRATO95237 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRATO95237 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRATO95237 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRATO95237 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRATO95237 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRATO95237 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRATO95237 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRATO95237 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRATO95237 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRATO95237 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRATO95237 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRATO95237 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRATO95237 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRATO95237 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRATO95237 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRATO95237 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRATO95237 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRATO95237 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRATO95237 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRATO95237 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRATO95237 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRATO95237 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRATO95237 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRATO95237 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRATO95237 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRATO95237 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRATO95237 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRATO95237 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRATO95237 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRATO95237 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRATO95237 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRATO95237 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRATO95237 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRATO95237 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRATO95237 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRATO95237 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRATO95237 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms