Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4BO95155 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms