Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSTN1O94985 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms