Protein–RNA interactions for Protein: O94929

ABLIM3, Actin-binding LIM protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM3O94929 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABLIM3O94929 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABLIM3O94929 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms