Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK1O94907 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK1O94907 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK1O94907 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK1O94907 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK1O94907 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK1O94907 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK1O94907 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK1O94907 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK1O94907 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK1O94907 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK1O94907 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK1O94907 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK1O94907 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK1O94907 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK1O94907 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK1O94907 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK1O94907 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK1O94907 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK1O94907 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK1O94907 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK1O94907 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK1O94907 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK1O94907 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK1O94907 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK1O94907 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DKK1O94907 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK1O94907 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK1O94907 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK1O94907 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK1O94907 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK1O94907 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK1O94907 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK1O94907 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK1O94907 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK1O94907 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK1O94907 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK1O94907 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK1O94907 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK1O94907 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK1O94907 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK1O94907 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK1O94907 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK1O94907 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK1O94907 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK1O94907 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK1O94907 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK1O94907 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK1O94907 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK1O94907 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK1O94907 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK1O94907 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK1O94907 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK1O94907 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK1O94907 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK1O94907 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK1O94907 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK1O94907 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK1O94907 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK1O94907 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK1O94907 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK1O94907 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK1O94907 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK1O94907 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK1O94907 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK1O94907 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK1O94907 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK1O94907 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK1O94907 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK1O94907 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK1O94907 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK1O94907 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK1O94907 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK1O94907 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK1O94907 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK1O94907 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK1O94907 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK1O94907 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK1O94907 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK1O94907 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DKK1O94907 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DKK1O94907 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DKK1O94907 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK1O94907 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK1O94907 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK1O94907 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK1O94907 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK1O94907 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK1O94907 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK1O94907 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK1O94907 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK1O94907 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK1O94907 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK1O94907 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK1O94907 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK1O94907 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK1O94907 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK1O94907 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK1O94907 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK1O94907 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms