Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM2O94769 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM2O94769 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM2O94769 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM2O94769 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM2O94769 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM2O94769 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM2O94769 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM2O94769 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM2O94769 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ECM2O94769 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM2O94769 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM2O94769 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM2O94769 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM2O94769 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM2O94769 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM2O94769 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM2O94769 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM2O94769 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM2O94769 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM2O94769 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM2O94769 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM2O94769 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM2O94769 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM2O94769 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM2O94769 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM2O94769 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM2O94769 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM2O94769 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM2O94769 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM2O94769 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM2O94769 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM2O94769 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM2O94769 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM2O94769 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM2O94769 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM2O94769 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM2O94769 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM2O94769 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM2O94769 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM2O94769 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM2O94769 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM2O94769 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM2O94769 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM2O94769 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM2O94769 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM2O94769 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM2O94769 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM2O94769 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM2O94769 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM2O94769 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ECM2O94769 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM2O94769 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM2O94769 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM2O94769 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM2O94769 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM2O94769 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM2O94769 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM2O94769 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM2O94769 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM2O94769 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM2O94769 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM2O94769 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM2O94769 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM2O94769 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM2O94769 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM2O94769 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM2O94769 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM2O94769 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM2O94769 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM2O94769 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM2O94769 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM2O94769 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM2O94769 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM2O94769 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM2O94769 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM2O94769 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM2O94769 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM2O94769 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM2O94769 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM2O94769 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM2O94769 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM2O94769 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM2O94769 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM2O94769 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM2O94769 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM2O94769 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM2O94769 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM2O94769 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM2O94769 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM2O94769 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM2O94769 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM2O94769 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM2O94769 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM2O94769 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM2O94769 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM2O94769 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM2O94769 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM2O94769 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM2O94769 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms