Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN5O75503 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN5O75503 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN5O75503 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN5O75503 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN5O75503 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN5O75503 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN5O75503 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN5O75503 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN5O75503 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN5O75503 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN5O75503 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN5O75503 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN5O75503 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN5O75503 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN5O75503 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN5O75503 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN5O75503 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN5O75503 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN5O75503 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN5O75503 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLN5O75503 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLN5O75503 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLN5O75503 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLN5O75503 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN5O75503 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN5O75503 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN5O75503 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN5O75503 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN5O75503 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN5O75503 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN5O75503 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN5O75503 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN5O75503 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN5O75503 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN5O75503 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN5O75503 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN5O75503 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN5O75503 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN5O75503 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN5O75503 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN5O75503 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN5O75503 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN5O75503 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN5O75503 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN5O75503 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN5O75503 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms