Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC4O75487 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC4O75487 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC4O75487 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC4O75487 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC4O75487 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC4O75487 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC4O75487 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC4O75487 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC4O75487 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC4O75487 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC4O75487 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC4O75487 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC4O75487 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC4O75487 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC4O75487 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC4O75487 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC4O75487 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC4O75487 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC4O75487 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC4O75487 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC4O75487 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC4O75487 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC4O75487 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC4O75487 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC4O75487 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC4O75487 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC4O75487 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC4O75487 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC4O75487 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC4O75487 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC4O75487 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC4O75487 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC4O75487 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC4O75487 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC4O75487 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC4O75487 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC4O75487 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC4O75487 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC4O75487 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC4O75487 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC4O75487 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC4O75487 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC4O75487 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC4O75487 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC4O75487 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC4O75487 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC4O75487 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC4O75487 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC4O75487 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC4O75487 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC4O75487 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC4O75487 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC4O75487 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC4O75487 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC4O75487 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC4O75487 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC4O75487 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC4O75487 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC4O75487 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC4O75487 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
GPC4O75487 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPC4O75487 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPC4O75487 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPC4O75487 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC4O75487 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC4O75487 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC4O75487 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC4O75487 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC4O75487 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC4O75487 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC4O75487 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC4O75487 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC4O75487 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC4O75487 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC4O75487 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC4O75487 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC4O75487 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC4O75487 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC4O75487 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC4O75487 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC4O75487 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC4O75487 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC4O75487 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC4O75487 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC4O75487 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC4O75487 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC4O75487 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC4O75487 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC4O75487 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC4O75487 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC4O75487 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC4O75487 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC4O75487 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC4O75487 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC4O75487 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC4O75487 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC4O75487 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC4O75487 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC4O75487 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms