Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF40O75150 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF40O75150 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF40O75150 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF40O75150 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF40O75150 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF40O75150 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF40O75150 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF40O75150 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF40O75150 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF40O75150 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF40O75150 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF40O75150 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF40O75150 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF40O75150 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF40O75150 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF40O75150 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF40O75150 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF40O75150 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF40O75150 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF40O75150 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF40O75150 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF40O75150 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF40O75150 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF40O75150 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF40O75150 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF40O75150 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF40O75150 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF40O75150 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF40O75150 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF40O75150 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF40O75150 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF40O75150 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF40O75150 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF40O75150 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF40O75150 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF40O75150 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF40O75150 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF40O75150 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF40O75150 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF40O75150 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF40O75150 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF40O75150 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF40O75150 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF40O75150 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF40O75150 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF40O75150 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF40O75150 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF40O75150 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF40O75150 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF40O75150 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF40O75150 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF40O75150 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF40O75150 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF40O75150 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF40O75150 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF40O75150 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF40O75150 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF40O75150 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF40O75150 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF40O75150 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF40O75150 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF40O75150 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF40O75150 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF40O75150 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF40O75150 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF40O75150 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF40O75150 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF40O75150 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF40O75150 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF40O75150 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF40O75150 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF40O75150 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF40O75150 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF40O75150 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF40O75150 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF40O75150 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF40O75150 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF40O75150 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF40O75150 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF40O75150 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF40O75150 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF40O75150 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF40O75150 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF40O75150 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF40O75150 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF40O75150 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF40O75150 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF40O75150 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF40O75150 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF40O75150 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF40O75150 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF40O75150 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF40O75150 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF40O75150 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF40O75150 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF40O75150 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF40O75150 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF40O75150 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF40O75150 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms