Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN2BO60939 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms