Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSPAN2O60636 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSPAN2O60636 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSPAN2O60636 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN2O60636 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSPAN2O60636 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms