Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA3O60609 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms