Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms