Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK2O60296 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms