Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRICKLE3O43900 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms