Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGTAO43765 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGTAO43765 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGTAO43765 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SGTAO43765 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SGTAO43765 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGTAO43765 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGTAO43765 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGTAO43765 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGTAO43765 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGTAO43765 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGTAO43765 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGTAO43765 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGTAO43765 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGTAO43765 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGTAO43765 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGTAO43765 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGTAO43765 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGTAO43765 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGTAO43765 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGTAO43765 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGTAO43765 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGTAO43765 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGTAO43765 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGTAO43765 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGTAO43765 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGTAO43765 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SGTAO43765 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGTAO43765 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGTAO43765 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SGTAO43765 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGTAO43765 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SGTAO43765 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGTAO43765 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGTAO43765 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGTAO43765 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGTAO43765 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGTAO43765 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGTAO43765 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGTAO43765 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGTAO43765 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGTAO43765 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGTAO43765 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGTAO43765 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGTAO43765 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGTAO43765 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGTAO43765 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGTAO43765 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGTAO43765 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGTAO43765 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGTAO43765 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGTAO43765 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGTAO43765 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGTAO43765 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGTAO43765 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGTAO43765 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGTAO43765 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGTAO43765 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGTAO43765 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGTAO43765 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SGTAO43765 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGTAO43765 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SGTAO43765 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGTAO43765 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SGTAO43765 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGTAO43765 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGTAO43765 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGTAO43765 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGTAO43765 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGTAO43765 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGTAO43765 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGTAO43765 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGTAO43765 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGTAO43765 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGTAO43765 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGTAO43765 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGTAO43765 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGTAO43765 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGTAO43765 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGTAO43765 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGTAO43765 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGTAO43765 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGTAO43765 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGTAO43765 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGTAO43765 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGTAO43765 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGTAO43765 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGTAO43765 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGTAO43765 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGTAO43765 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGTAO43765 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGTAO43765 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGTAO43765 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGTAO43765 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGTAO43765 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGTAO43765 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGTAO43765 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGTAO43765 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGTAO43765 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGTAO43765 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms